食道は食道入り口部から食道胃接合部までの約25cmの長さがあります。内視鏡を用いた早期食道がんの診断では、表面の凹凸、発赤調の色調変化、血管透見の消失を参考に、特殊光（BLI／NBI）下にbrownish area（BA）として検出します。食道表在がんを診断するうえで、もう一つ重要なのが、病変内の上皮乳頭内血管ループ（Intra-epithelial Papillary Capillary Loop: IPCL）です。表在がんの場合はこのIPCLが拡張して通常内視鏡でもドット状血管として観察することができます。がんではなく炎症性変化による病変の場合でもBAやドット状血管を認める場合はありますので、依然、病理検査による最終診断が必要です。食道がんは粘膜内にとどまる病変のみが早期がんであり、粘膜下に浸潤した場合は早期がんとは呼びません。粘膜下に浸潤した場合のリンパ節転移率は胃がんの2倍になりますので、胃がん以上に早期診断が重要です。
食道がんでも、食道胃接合部のがんは状況が違ってきます。この部位では胃酸の逆流があると逆流性食道炎を起こします。食道粘膜はもともと扁平上皮なのですが、逆流性食道炎により扁平上皮が円柱上皮に変化します。この円柱上皮化した部分は、色調が変化するので内視鏡ですぐにわかります。この円柱上皮化した粘膜をバレット粘膜と呼びます（米国では、円柱上皮からさらに腸上皮化生を伴った場合をバレット粘膜と呼びます）。すなわち、バレット粘膜は本来の食道胃接合部（EGJ: Esophago-Gastric Junction）と扁平上皮・円柱上皮接合部（SCJ: Squamous-Columnar Junction）の間の部分となります。バレット粘膜を持つ食道をバレット食道と呼びます。そしてバレット粘膜が3cm未満の場合がSSBE（Short Segment Barrett’s Esophagus）、3cm以上の場合がLSBS（Long Segment Barrett’s Esophagus）です。LSBEの場合はバレット粘膜由来のがん（バレット食道腺がん）のリスクがより高くなります。欧米ではLSBEの頻度が高く、また食道がんの半分以上が腺がんであることから、その発生母地であるLSBEのサーベイランスを積極的に行い、必要に応じて予防治療します。

逆流性食道炎は胃食道逆流症：Gastro Esophageal Reflux Disease (GERD)があることにより食道下端の食道胃接合部に “びらん” を生じる病態です。内視鏡により明確に診断でき、改定ロサンゼルス分類によりその程度を客観的に評価します（Grade M, A, B, C, D）。食道炎が持続するとバレット粘膜を生じることがあり、こちらはプラハ分類によりその長さを客観的に評価します。例えば全周長（C）が3cmで、最大長（M）が5cmなら、C3M5となります。このバレット粘膜の長さはバレット食道腺がんを合併するリスクと相関があります。胸やけ、つかえ感、咽頭違和感がある方は、是非一度検査されることをおすすめします。

胃がんの早期診断には内視鏡検査が必須で、特殊光（LCI）によるスクリーニングと、疑わしい病変にはインジゴカルミン染色が有用で、病変部を生検することにより病理学的にも確認し、確定診断となります。胃がんの一番の危険因子はヘリコバックター・ピロリ菌ですが、このピロリ菌に対する除菌治療を行い除菌に成功した場合でも、胃粘膜萎縮と腸上皮化成は一部残ります。このため、胃がんのリスクも低下したとはいえ残ります。この場合、残存した腸上皮化生などの変化により早期診断が難しい場合があり、より丁寧な検査が必要です。胃がんの粘膜下に浸潤した場合のリンパ節転移陽性率は、食道がんよりは低いのですが、大腸がんと比較すると高く、やはり早期発見が重要です。